Такой "плавающий" дефект, вероятнее всего, вызван плохой балансировкой дисков.
Так например в моей Yamaha DVD-S520 так же часть дисков шумит, а часть работает абсолютно тихо. Причем дефект возникает на одних и тех же дисках и чаще всего в одних и тех же местах.
Советую посмотреть связь шума и конкретных дисков, т.е. от одих и тех же. Если же шум возникает на разных дисках и в разных местах, то плеер в ремонт!