Да просто пользовать, прогонять как обычно полные циклы. Для удобства, чтобы не оказаться где-то с разряженным аккумулятором, можно подзаряжать его, когда удобно, а не когда он полность "сядет". Имелось ввиду, если не собираетесь пользоваться услугами аккумулятора долгое время (на отпуск, к примеру), не стоит оставлять его разряженным.
Кстати, Li-Ion аккумуляторы тоже ограничены по кол-ву зарядок...